TR
Dil seçin:
EN AZ RU UZ KS

KLL (Kronik Lenfositik Lösemi) Panelleri

KLL panelleri ile kronik lenfositik lösemide genetik değerlendirme, risk sınıflandırması ve tedavi planlamasına yönelik testler

OKU

 

KLL Temel Panel

Basamak

Test / Yöntem

Hedef / Kapsam

Amaç / Açıklama

1. del(17p)/TP53 FISH analizi

del(17p13.1)/TP53 FISH

17p13.1 / TP53

del(17p13.1)/TP53 delesyonunun saptanması; TP53 mutasyon analizi ile birlikte TP53 aberasyon durumunun değerlendirilmesi. TP53 aberasyonu tedavi seçimi açısından kritik önemdedir.

2. TP53 moleküler analiz

TP53 NGS

TP53 tam kodlama bölgesi (ekzon 2–11) ve splice-site bölgeleri; SNV/indel; laboratuvarın valide analitik LoD’si üzerindeki raporlanabilir TP53 varyantları.

del(17p) olmasa dahi TP53 mutasyonlarının saptanması. Sabit bir VAF raporlama eşiği kullanılmaz; laboratuvarın valide analitik LoD’si esas alınır. TP53 mutasyon durumu del(17p) FISH sonucu ile birlikte değerlendirilir ve tedavi seçimi açısından kritik öneme sahiptir.

3. IGHV analizi

IGHV yeniden düzenlenme / SHM analizi

Produktif klonotipik IGHV-IGHD-IGHJ rearrangement; germline nükleotid kimliği ve SHM durumu; valide ise BcR IG stereotyped subset analizi (özellikle #2 ve #8)

M-CLL / U-CLL sınıflaması, prognostik değerlendirme ve tedavi planlamasına katkı. Valide stereotypy analizinde klinik önemi yerleşik subset #2 ve #8 ayrıca belirtilebilir. IGHV durumu genellikle bir kez belirlenir.

 

KLL Geniş Panel

Basamak

Test / Yöntem

Hedef / Kapsam

Amaç / Açıklama

1. İleri sitogenetik değerlendirme

Kromozom analizi (CpG/DSP30 ± IL-2 ile uyarılmış kültür)

Kompleks karyotip ve ek sayısal/yapısal kromozomal anomaliler

Kompleks karyotip ile birlikte, hedefli FISH panelinde değerlendirilmeyen ek sayısal ve yapısal kromozomal anomalilerin saptanması ve ileri sitogenetik karakterizasyonu. Geniş kapsamında ileri karakterizasyon amacıyla yer alır; EHA 2026'ya göre klinik çalışma dışında rutin tedavi öncesi değerlendirme olarak önerilmemektedir.

2. Genişletilmiş FISH analizi

del(6q) / MYB

6q23.3 / MYB

del(6q)/MYB: ek sitogenetik/prognostik bilgi sağlar; tedavi seçimini tek başına belirlemez.

ATM delesyonu

11q22.3 / ATM

del(11q22.3)/ATM: ek sitogenetik/prognostik bilgi sağlar; tedavi seçimini tek başına belirlemez.

Trizomi 12 / CEP12

Kromozom 12 sentromerik sinyal sayısı

Trizomi 12: ek sitogenetik/prognostik bilgi sağlar; tedavi seçimini tek başına belirlemez.

del(13q14.2) / D13S319

13q14.2 / D13S319 (DLEU1/MIR15A-MIR16-1)

del(13q14.2)/D13S319: ek sitogenetik/prognostik bilgi sağlar; tedavi seçimini tek başına belirlemez. İzole bulgu diğer klinik/genetik verilerle birlikte yorumlanır.

TP53 delesyonu

17p13.1 / TP53

del(17p13.1)/TP53 delesyonunun saptanması; TP53 mutasyon analizi ile birlikte TP53 aberasyon durumunun değerlendirilmesi.

IGH rearrangement / Break-apart FISH

14q32 / IGH rearrangement

IGH lokusunu içeren yeniden düzenlenmelerin taranması. Pozitif olgularda klinik/morfolojik bulgular doğrultusunda IGH::CCND1 [t(11;14)] ve/veya IGH::BCL3 [t(14;19)] için partner-spesifik refleks FISH uygulanabilir.

3. TP53 moleküler analiz

TP53 NGS

TP53 tam kodlama bölgesi (ekzon 2–11) ve splice-site bölgeleri; SNV/indel; laboratuvarın valide analitik LoD’si üzerindeki raporlanabilir TP53 varyantları.

del(17p) olmasa dahi TP53 mutasyonlarının saptanması. Sabit bir VAF raporlama eşiği kullanılmaz; laboratuvarın valide analitik LoD’si esas alınır. TP53 mutasyon durumu del(17p) FISH sonucu ile birlikte değerlendirilir ve tedavi seçimi açısından kritik öneme sahiptir.

4. IGHV analizi

IGHV yeniden düzenlenme / SHM analizi

Produktif klonotipik IGHV-IGHD-IGHJ rearrangement; germline kimlik oranı; valide ise BcR IG stereotyped subset analizi (özellikle #2 ve #8)

M-CLL / U-CLL sınıflaması ve prognostik/tedavi planlamasına katkı; valide stereotypy analizinde subset #2 ve #8 ayrıca değerlendirilebilir.

5. Geniş moleküler profil

Geniş KLL Moleküler Profil

NOTCH1, SF3B1, BIRC3, ATM, XPO1, POT1, NFKBIE, RPS15, MYD88, EGR2, SAMHD1 vb.; valide kapsamda CNV

Ek somatik/prognostik profilleme; TP53 dışındaki bulgular tedavi seçimini tek başına belirlemez.

KLL Temel = del(17p)/TP53 FISH + TP53 NGS + IGHV SHM analizi.
KLL Geniş = KLL Temel + ileri sitogenetik değerlendirme (CpG/DSP30 ± IL-2 ile uyarılmış kromozom analizi) + ek genişletilmiş FISH hedefleri [del(6q)/MYB, del(11q22.3)/ATM, +12/CEP12, del(13q14.2)/D13S319, IGH break-apart] + geniş KLL moleküler profil.
Geniş kapsamındaki genişletilmiş sitogenetik ve moleküler incelemeler ileri biyolojik/prognostik karakterizasyon amacı taşır. EHA 2026'ya göre kompleks karyotip değerlendirmesi klinik çalışma dışında rutin tedavi öncesi değerlendirme olarak önerilmemekte; TP53 dışındaki geniş genomik profilleme ise rutin klinik uygulamada önerilmemektedir.

 

KLL Temel Panel ve Geniş Panel

KLL Temel Paneli, tanısı hematolojik ve akım sitometrik bulgularla konulmuş kronik lenfositik lösemi (KLL) olgularında tedavi öncesi genetik risk ve prediktif biyobelirteçlerin değerlendirilmesi amacıyla oluşturulmuş bir test yaklaşımıdır. Temel, KLL tanısını koyan akım sitometrik immünfenotiplemenin yerine geçmez.

KLL’de tedavi seçimi ve prognostik değerlendirme açısından özellikle TP53 aberasyonları [del(17p) ve/veya TP53 mutasyonu] ile IGHV somatik hipermutasyon durumu önemlidir. FISH, TP53 dizilemesi ve IGHV analizi birbirini tamamlayan yöntemlerdir.

 

Temel Panel kapsamında birbirini tamamlayan yöntemler

  • Temel kapsamında del(17p13.1)/TP53 FISH ile 17p delesyonu değerlendirilir. del(17p) sonucu, TP53 mutasyon analizi ile birlikte TP53 aberasyon durumu açısından yorumlanır.
  • TP53 NGS ile del(17p) bulunmasa dahi TP53 mutasyonları araştırılır; del(17p) ve TP53 mutasyonu birlikte “TP53 aberasyonu” açısından yorumlanır.
  • IGHV analizi ile klonotipik produktif IGHV-IGHD-IGHJ yeniden düzenlenmesinin somatik hipermutasyon (SHM) durumu belirlenir; valide ise klinik önemi yerleşik BcR IG stereotyped subsetleri (özellikle #2 ve #8) ayrıca değerlendirilebilir.
  • Geniş kapsamında Temel bileşenlerine ek olarak ileri sitogenetik değerlendirme [CpG/DSP30 ± IL-2 ile uyarılmış kromozom analizi], ek genişletilmiş FISH hedefleri [del(6q)/MYB, del(11q22.3)/ATM, +12/CEP12, del(13q14.2)/D13S319 ve IGH (14q32) break-apart] ve geniş KLL moleküler profil uygulanır. Bu ek bileşenler ileri biyolojik/prognostik karakterizasyon amacı taşır. EHA 2026'ya göre kompleks karyotip değerlendirmesi klinik çalışma dışında rutin tedavi öncesi değerlendirme olarak önerilmemekte; TP53 dışındaki geniş genomik profilleme ise rutin klinik uygulamada önerilmemektedir.

 

TP53 Aberasyonlarının Değerlendirilmesi

del(17p) değerlendirmesinde FISH temel yöntemdir; NGS tabanlı CNV analizi, özellikle düşük tümör fraksiyonunda del(17p) FISH’in yerini alacak şekilde kullanılmamalıdır. TP53 mutasyon analizi için NGS tercih edilen yöntemdir. ERIC 2024 yaklaşımına göre optimum kapsam TP53 kodlama bölgesinin ekzon 2-11’ini ve splice-site bölgelerini içerir; sabit bir VAF raporlama eşiği yerine laboratuvarın valide analitik LoD’si esas alınmalı ve bu sınırın üzerindeki klinik anlamlı TP53 varyantları raporlanmalıdır.

TP53 analizi örnek tümör hücre oranı dikkate alınarak yorumlanmalıdır. Periferik kan çoğu KLL olgusunda uygundur; düşük dolaşan CLL hücre oranında (özellikle düşük mutlak lenfosit sayısı/tümör fraksiyonu bulunan örneklerde) CD19+ hücre zenginleştirme, kemik iliği veya uygun doku örneği gerekebilir.

 

IGHV Mutasyon Durumu

IGHV SHM durumu klonotipik produktif rearrangement üzerinden değerlendirilir. Germline IGHV dizisine nükleotid kimliği ≥%98 ise U-CLL (unmutated), <%98 ise M-CLL (mutated) olarak sınıflandırılır. Germline kimliği %97.00–97.99 arasında olan olgular M-CLL sınıfında yer almakla birlikte ayrıca “borderline” olarak belirtilir ve prognostik yorumda dikkatle değerlendirilir. Non-produktif rearrangement’a M-CLL/U-CLL sınıflaması verilmez. ERIC önerilerine uygun ve valide stereotypy analizinde klinik önemi en yerleşik subsetler #2 ve #8’dir; subset #2 olumsuz prognostik özelliklerle, subset #8 ise artmış Richter transformasyonu riskiyle ilişkilidir. Hedefe yönelik tedaviler çağındaki prediktif önemleri ise henüz kesin değildir.

IGHV mutasyon durumu klonal olarak stabil kabul edildiğinden genellikle bir kez belirlenmesi yeterlidir; tedavi hatları arasında rutin tekrar gerektirmez.

 

KLL Geniş Panel Yaklaşımı

KLL Geniş Panel, Temel'in temel prediktif/risk belirteçlerine ek olarak ileri sitogenetik değerlendirme, genişletilmiş FISH profili ve geniş somatik DNA-NGS profillemesi ile daha kapsamlı biyolojik/prognostik karakterizasyon sağlar. NOTCH1, SF3B1, BIRC3, ATM, XPO1, POT1, NFKBIE, RPS15, MYD88, EGR2, SAMHD1 ve diğer KLL ilişkili genlerdeki değişiklikler hastalık biyolojisi ve prognoz açısından bilgi sağlayabilir; ancak klinik aksiyonabiliteleri TP53 ile eşdeğer değildir. EHA 2026'ya göre kompleks karyotip değerlendirmesi klinik çalışma dışında rutin tedavi öncesi değerlendirme olarak önerilmemekte; TP53 dışındaki geniş genomik profilleme ise rutin klinik uygulamada önerilmemektedir. Geniş bileşenleri ileri karakterizasyon amacıyla yorumlanmalıdır.

 

Geniş İleri Sitogenetik Değerlendirmesi: Uyarılmış Karyotip/Kompleks Karyotip

KLL hücrelerinin düşük spontan mitotik aktivitesi nedeniyle kromozom analizi uygun mitojenik uyarım ile yapılmalıdır. Geniş kapsamında CpG/DSP30 ± IL-2 ile uyarılmış kromozom analizi kullanılarak kompleks karyotip ve genişletilmiş FISH paneli dışında kalan ek sayısal/yapısal kromozomal anomaliler değerlendirilebilir. Kompleks karyotip genellikle ≥3 klonal sitogenetik anomali, yüksek kompleksite (high-CK) ise ≥5 anomali olarak tanımlanır. Bu inceleme Geniş içinde ileri sitogenetik karakterizasyon amacıyla yer almakla birlikte, EHA 2026'ya göre klinik çalışma dışında rutin tedavi öncesi değerlendirme olarak önerilmemektedir.

 

Test Zamanlaması ve Tekrar Analizleri

KLL’de genetik profil klonal evrim gösterebilir. Bu nedenle tedavi endikasyonu oluştuğunda ve her yeni tedavi hattı planlanırken TP53 aberasyon durumu [del(17p) + TP53 mutasyonu] yeniden değerlendirilmelidir. IGHV mutasyon durumu ise genellikle stabil olduğundan bir kez, tercihen ilk tedavi öncesinde belirlenir.

  • İlk tedavi öncesi: del(17p)/TP53 FISH + TP53 mutasyon analizi + IGHV SHM durumu Temel'in temel genetik değerlendirmesidir. Genişletilmiş FISH hedefleri [del(6q)/MYB, del(11q22.3)/ATM, +12/CEP12, del(13q14.2)/D13S319 ve IGH break-apart] Geniş kapsamında ek sitogenetik/prognostik veya ayırıcı tanısal bilgi amacıyla değerlendirilebilir.
  • Geniş seçildiğinde: Temel bileşenlerine ek olarak CpG/DSP30 ± IL-2 ile uyarılmış kromozom analizi, genişletilmiş KLL FISH profili ve geniş KLL moleküler profil uygulanır. Bu ek incelemeler ileri biyolojik/prognostik karakterizasyon amacı taşır ve EHA 2026 çekirdek tedavi öncesi biyobelirteç setinin parçası değildir.
  • Sonraki tedavi hatları öncesi: del(17p)/FISH ve TP53 mutasyon durumu yeniden değerlendirilmelidir; geniş moleküler testler klinik bağlama göre tekrarlanabilir.
  • IGHV: daha önce güvenilir şekilde belirlenmişse rutin olarak tekrar edilmez.

 

Takip ve Ek/İleri Değerlendirmeler

Temel / Geniş sonuçlarına, kullanılan tedaviye, relaps/progresyon paternine ve klinik gereksinime göre bazı takip testleri, tedavi sürecinde ek incelemeler veya daha ileri değerlendirmeler ikinci aşamada planlanabilir.

 

Hedefe Yönelik Direnç Mutasyonları

BTK inhibitörü veya BCL2 inhibitörü tedavisi sonrasında progresyon/direnç gelişen seçilmiş olgularda BTK, PLCG2 ve BCL2 gibi tedavi direnciyle ilişkili hedefler klinik gereksinime göre analiz edilebilir. Bu testler yeni tanı KLL Temel’in rutin başlangıç içeriğinde yer almaz. Direnç mutasyonunun saptanması biyolojik bilgi sağlayabilir; ancak tek başına tedavi değişikliği gerekçesi olarak kullanılmamalı ve klinik progresyon, kullanılan ajan ve tedavi öyküsü ile birlikte yorumlanmalıdır.

 

Richter Transformasyonu Şüphesi

Hızlı klinik progresyon, belirgin LDH artışı, yeni/büyüyen nodal kitle veya diğer klinik bulgularla Richter transformasyonu şüphesi oluştuğunda tercih edilen yaklaşım uygun lezyondan doku biyopsisi ve patolojik doğrulamadır. Genetik/moleküler analizler doku bulguları ve klinik gereksinime göre genişletilebilir; bu durum KLL Temel’in rutin başlangıç kapsamından ayrıdır.

 

MRD Değerlendirmesi

Ölçülebilir rezidüel hastalık (MRD) KLL’de prognostik ve araştırma açısından değerlidir; ancak başlangıç Temel/Geniş panelinin rutin bileşeni değildir. MRD, kullanılan zaman-sınırlı tedavi protokolü, klinik çalışma veya özel klinik gereksinime göre valide çok parametreli akım sitometri ve/veya moleküler yöntemlerle ayrı takip testi olarak planlanabilir.

 

Bütüncül Değerlendirme

KLL Temel; del(17p)/TP53 FISH, TP53 mutasyon analizi ve IGHV SHM durumu ile EHA 2026'ya uyumlu temel tedavi öncesi genetik risk/prediktif profili oluşturmayı amaçlar. KLL Geniş ise buna ileri sitogenetik değerlendirme [CpG/DSP30 ± IL-2 ile uyarılmış kromozom analizi], genişletilmiş KLL FISH profili ve geniş somatik moleküler profillemeyi ekler. Geniş'ın ek bileşenleri ileri biyolojik/prognostik karakterizasyon amacıyla yorumlanmalı; rutin tedavi seçimi açısından TP53 aberasyonları ve IGHV ile aynı ağırlıkta değerlendirilmemelidir. Tedavi sürecindeki direnç analizleri ve MRD değerlendirmeleri ayrı klinik endikasyonlarla planlanır.

 

RUTİN / TAKİP / EK-İLERİ ANALİZ KAPSAMI

KLL Temel ve Geniş bileşenleri ile seçilmiş klinik durumlarda uygulanacak tedavi sürecindeki ek incelemeler, ek/ileri değerlendirmeler ve takip testleri aşağıda özetlenmiştir. KLL tanısının akım sitometrik immünfenotipleme ile konulduğu varsayılır.

Durum

Test / Yöntem

Hedef / Kapsam

Zaman

Amaç / Açıklama

Temel

del(17p)/TP53 FISH

17p13.1 / TP53 delesyonu

İlk tedavi öncesi ve her yeni tedavi hattı öncesi

del(17p)/TP53 delesyonunun saptanması; TP53 mutasyon analizi ile birlikte TP53 aberasyon durumunun belirlenmesi.

Temel

TP53 NGS

TP53 tam kodlama bölgesi (ekzon 2–11) ve splice-site bölgeleri; SNV/indel; laboratuvarın valide analitik LoD’si üzerindeki raporlanabilir TP53 varyantları.

Her yeni tedavi hattı öncesi

TP53 mutasyonlarının saptanması; del(17p) ile birlikte TP53 aberasyon durumunun belirlenmesi.

Temel

IGHV SHM analizi

Produktif IGHV-IGHD-IGHJ; germline kimlik oranı; valide ise stereotyped subset #2/#8

Genellikle bir kez

M-CLL/U-CLL sınıflaması ve prognostik/tedavi planlamasına katkı; valide ise klinik önemi yerleşik BcR IG subsetleri #2 ve #8 ayrıca raporlanabilir.

Geniş

Uyarılmış kromozom analizi (CpG/DSP30 ± IL-2)

Kompleks karyotip ve ek sayısal/yapısal kromozomal değişiklikler

İleri karakterizasyon amacıyla / seçilmiş olgularda

Kompleks karyotip ve genişletilmiş FISH paneli dışında kalan ek kromozomal değişikliklerin değerlendirilmesi. Geniş kapsamında ileri sitogenetik bileşen olarak yer alır; EHA 2026'ya göre klinik çalışma dışında rutin tedavi öncesi değerlendirme olarak önerilmemektedir.

Geniş

Genişletilmiş KLL FISH profili

del(6q)/MYB; del(11q22.3)/ATM; +12/CEP12; del(13q14.2)/D13S319; del(17p13.1)/TP53; IGH (14q32) break-apart

İleri karakterizasyon amacıyla / klinik gereksinime göre

Ek sitogenetik/prognostik ve ayırıcı tanısal karakterizasyon. IGH break-apart pozitifliğinde klinik/morfolojik bağlama göre IGH::CCND1 ve/veya IGH::BCL3 için partner-spesifik refleks FISH uygulanabilir.

Geniş

Geniş KLL Moleküler Profil

KLL ilişkili somatik genler; valide kapsamda CNV

Seçilmiş olgularda / klinik gereksinime göre

Ek moleküler/prognostik karakterizasyon; TP53 dışındaki geniş gen profilinin rutin tedavi seçimini tek başına belirlemediği dikkate alınır.

Tedavi sürecinde ek inceleme

BTK / PLCG2 / BCL2 direnç analizi

Tedaviye özgü direnç varyantları

İlgili hedefli tedavi sonrası progresyonda

Direnç mekanizmasının araştırılması; yeni tanıda rutin değildir ve mutasyon sonucu tek başına tedavi değişikliği gerekçesi değildir.

Ek / ileri inceleme

Doku biyopsisi + geniş moleküler profil

Richter transformasyonu şüphesi

Klinik şüphede

Transformasyonun patolojik doğrulanması ve gerektiğinde ileri genetik karakterizasyon.

Takip / MRD

MRD analizi

Valide flow ve/veya moleküler yöntem

Protokole göre

Rutin başlangıç panelinden ayrı takip testi; klinik protokol/çalışmaya göre kullanılır.

Kılavuz uyumu notu: Temel, EHA 2026 yaklaşımına uygun olarak del(17p)/TP53 FISH, TP53 mutasyon analizi ve IGHV SHM durumunu temel tedavi öncesi genetik değerlendirme olarak içerir. TP53 aberasyonları [del(17p) + TP53 mutasyonu] her tedavi hattı öncesinde; IGHV SHM durumu ise genellikle bir kez, tercihen ilk tedavi öncesinde değerlendirilir. Geniş'taki genişletilmiş FISH, uyarılmış kromozom analizi/kompleks karyotip ve TP53 dışındaki geniş moleküler profil ileri biyolojik/prognostik karakterizasyon amacı taşır ve rutin tedavi seçimi için çekirdek biyobelirteçlerle aynı ağırlıkta yorumlanmamalıdır.

Önemli: del(17p) için FISH, TP53 mutasyonu için dizileme gereklidir; bu iki analiz birbirinin yerine geçmez. TP53 NGS raporlamasında laboratuvarın valide LoD'si esas alınmalıdır. Geniş kapsamında yer alan genişletilmiş FISH, kompleks karyotip ve TP53 dışındaki geniş somatik panel bulguları klinik bağlamda ek biyolojik/prognostik bilgi olarak değerlendirilmelidir.

 

TEKNİK ANALİZ KAPSAMI VE GEN LİSTESİ

Geniş KLL Moleküler Profil uygulanması halinde bu bölümde yer alan 443 gen, testin teknik Full CDS analiz kapsamını gösterir. Bu liste, KLL'de tüm genlerin rutin klinik olarak önerildiği, eşdeğer ağırlıkta yorumlandığı veya tedavi kararını belirlediği anlamına gelmez. Klinik yorum, valide analiz kapsamı ve güncel kanıt düzeyi doğrultusunda yapılır; EHA 2026'ya göre TP53 dışındaki geniş genomik profilleme rutin klinik uygulamada önerilmemektedir. Liste dışındaki genler açısından negatif sonuç veya analitik duyarlılık garantisi verilmez.

GENİŞ KLL MOLEKÜLER PROFİL - TEKNİK FULL CDS GEN LİSTESİ

Aşağıdaki genler laboratuvarın valide Full-CDS teknik DNA-NGS kapsamındadır. KLL’ye özgü klinik yorumlama; TP53 başta olmak üzere KLL ile ilişkili yerleşik ve klinik açıdan anlamlı genler üzerinden yapılır. Liste içerisindeki tüm genlerin KLL’de eşdeğer klinik önemi olduğu anlamına gelmez.

GEN 1

GEN 2

GEN 3

GEN 4

GEN 5

GEN 6

GEN 7

ABL1

ABL2

ACTB

AKT1

AKT2

AKT3

ALK

AMER1

ANKRD26

AP3B1

APC

AR

ARAF

ARHGAP26

ARID1A

ARID1B

ARID2

ARID5B

ASXL1

ASXL2

ASXL3

ATG5

ATM

ATR

ATRX

ATXN1

AURKA

AURKB

AXIN1

AXL

B2M

BAALC

BAP1

BARD1

BCL10

BCL11A

BCL11B

BCL2

BCL6

BCL7A

BCOR

BCORL1

BIRC3

BLM

BLNK

BRAF

BRCA1

BRCA2

BRD4

BTG1

BTG2

BTK

BTLA

CALR

CARD11

CBFB

CBL

CBLB

CCND1

CCND2

CCND3

CCNE1

CCR4

CCR7

CCT6B

CD22

CD27

CD274

CD28

CD58

CD70

CD79A

CD79B

CD83

CDC42

CDC73

CDH1

CDK12

CDK4

CDK6

CDK8

CDKN1A

CDKN1B

CDKN1C

CDKN2A

CDKN2B

CDKN2C

CEBPA

CEP57

CHD2

CHD8

CHEK1

CHEK2

CIITA

CKS1B

CNOT3

CREBBP

CRLF2

CSF1R

CSF3R

CTCF

CTLA4

CTNNB1

CUX1

CXCR4

CYLD

DAXX

DDR2

DDX3X

DDX41

DHX15

DNM2

DNMT3A

DOT1L

DTX1

DUSP2

DUSP22

EBF1

ECT2L

EED

EGFR

EGR2

EP300

EPCAM

EPHA2

EPHA3

EPHA5

EPHA7

EPOR

ERBB2

ERBB3

ERBB4

ERCC4

ERG

ESR1

ETNK1

ETS1

ETV1

ETV4

ETV6

EZH2

TENT5C

FANCA

FANCC

FANCD2

FANCE

FANCF

FANCG

FANCI

BRIP1

FANCL

FANCM

FAS

FAT1

FAT4

FBXO11

FBXW7

FGFR1

FGFR2

FGFR3

FGFR4

FH

FLCN

FLT1

FLT3

FLT4

FOXO1

FOXO3

FOXP1

FYN

GADD45B

GATA1

GATA2

GATA3

GNA11

GNA13

GNAQ

GNAS

GNB1

GRIN2A

HACE1

HBA1

HBA2

HBB

HDAC1

HDAC4

HDAC7

HGF

HIST1H1A

HIST1H1C

HIST1H1D

H1-4

HNF1A

HRAS

ID3

IDH1

IDH2

IFNAR2

IGF1R

IGH

IGK

IGL

IGLL5

IKBKE

IKZF1

IKZF2

IKZF3

IL3

IL7R

INPP4B

INPP5D

IRF1

IRF4

IRF8

ITK

ITPKB

JAK1

JAK2

JAK3

JARID2

JUN

KAT6A

KDM2B

KDM5A

KDM5C

KDM6A

KDR

KIT

KLF2

KLHL5

KLHL6

KMT2A

KMT2B

KMT2C

KMT2D

KRAS

LEF1

LMO2

LRP1B

LTB

LYN

LYST

MAF

MAFB

MALT1

MAP2K1

MAP2K2

MAP2K4

MAP3K1

MAP3K14

MAPK1

MCL1

MDM2

MDM4

MED12

MEF2B

MEF2D

MEN1

MET

MFHAS1

MGA

MITF

MLH1

MPL

MSH2

MSH3

MSH6

MTOR

MUTYH

MYB

MYC

MYCL

MYCN

MYD88

NBN

NCKAP1L

NCSTN

NF1

NF2

NFE2L2

NFKB1

NFKB2

NFKBIA

NFKBIE

NKX2-1

NLRC4

NOTCH1

NOTCH2

NPM1

NRAS

NSD1

NT5C2

NTRK1

NTRK3

NUP98

P2RY8

PAG1

PAK3

PALB2

PAX5

PBRM1

PC

PDCD1

PDCD1LG2

PDGFRA

PDGFRB

PDK1

PHF6

PIK3CA

PIK3CD

PIK3R1

PIK3R2

PIM1

PLCG1

PLCG2

PML

PMS2

POLE

POT1

POU2AF1

PPM1D

PPP2R1A

PRDM1

PRF1

PRKCB

PRPF8

PTCH1

PTEN

PTPN1

PTPN11

PTPN2

PTPN6

PTPRD

PTPRK

PTPRO

RAB27A

RAD21

RAD50

RAD51

RAF1

RARA

RASGEF1A

RB1

RECQL4

REL

RELN

RET

RHOA

RICTOR

RNF43

ROS1

RPL10

RPL22

RPL5

RPS15

RPTOR

RUNX1

SAMD9

SAMD9L

SAMHD1

SBDS

SDHA

SDHB

SDHC

SDHD

SETBP1

SETD2

SF3B1

SGK1

SH2B3

SH2D1A

SLC19A1

SLC7A7

SMAD2

SMAD4

SMARCA2

SMARCA4

SMARCB1

SMC1A

SMC3

SMO

SOCS1

SOX11

SOX2

SPEN

SPOP

SRC

SRP72

SRSF2

STAG2

STAT3

STAT4

STAT5A

STAT5B

STAT6

STK11

STX11

STXBP2

SUFU

SUZ12

SYK

TBL1XR1

TCF3

TCL1A

TERC

TERT

TET1

TET2

TET3

TGFBR2

TNFAIP3

TNFRSF11A

TNFRSF14

TNFRSF17

TNFRSF1B

TOP1

TOP2A

TP53

TP63

TP73

TRAF2

TRAF3

TRAF5

TSC1

TSC2

TSHR

TYK2

U2AF1

UNC13D

USP7

VAV1

VHL

NSD2

WT1

XIAP

XPC

XPO1

ZAP70

ZBTB7A

ZEB2

ZFP36L2

ZMYM3

ZRSR2