|
KLL Temel Panel |
|||
|
Basamak |
Test / Yöntem |
Hedef / Kapsam |
Amaç / Açıklama |
|
1. del(17p)/TP53 FISH analizi |
del(17p13.1)/TP53 FISH |
17p13.1 / TP53 |
del(17p13.1)/TP53 delesyonunun saptanması; TP53 mutasyon analizi ile birlikte TP53 aberasyon durumunun değerlendirilmesi. TP53 aberasyonu tedavi seçimi açısından kritik önemdedir. |
|
2. TP53 moleküler analiz |
TP53 NGS |
TP53 tam kodlama bölgesi (ekzon 2–11) ve splice-site bölgeleri; SNV/indel; laboratuvarın valide analitik LoD’si üzerindeki raporlanabilir TP53 varyantları. |
del(17p) olmasa dahi TP53 mutasyonlarının saptanması. Sabit bir VAF raporlama eşiği kullanılmaz; laboratuvarın valide analitik LoD’si esas alınır. TP53 mutasyon durumu del(17p) FISH sonucu ile birlikte değerlendirilir ve tedavi seçimi açısından kritik öneme sahiptir. |
|
3. IGHV analizi |
IGHV yeniden düzenlenme / SHM analizi |
Produktif klonotipik IGHV-IGHD-IGHJ rearrangement; germline nükleotid kimliği ve SHM durumu; valide ise BcR IG stereotyped subset analizi (özellikle #2 ve #8) |
M-CLL / U-CLL sınıflaması, prognostik değerlendirme ve tedavi planlamasına katkı. Valide stereotypy analizinde klinik önemi yerleşik subset #2 ve #8 ayrıca belirtilebilir. IGHV durumu genellikle bir kez belirlenir. |
|
KLL Geniş Panel |
|||
|
Basamak |
Test / Yöntem |
Hedef / Kapsam |
Amaç / Açıklama |
|
1. İleri sitogenetik değerlendirme |
Kromozom analizi (CpG/DSP30 ± IL-2 ile uyarılmış kültür) |
Kompleks karyotip ve ek sayısal/yapısal kromozomal anomaliler |
Kompleks karyotip ile birlikte, hedefli FISH panelinde değerlendirilmeyen ek sayısal ve yapısal kromozomal anomalilerin saptanması ve ileri sitogenetik karakterizasyonu. Geniş kapsamında ileri karakterizasyon amacıyla yer alır; EHA 2026'ya göre klinik çalışma dışında rutin tedavi öncesi değerlendirme olarak önerilmemektedir. |
|
2. Genişletilmiş FISH analizi |
del(6q) / MYB |
6q23.3 / MYB |
del(6q)/MYB: ek sitogenetik/prognostik bilgi sağlar; tedavi seçimini tek başına belirlemez. |
|
ATM delesyonu |
11q22.3 / ATM |
del(11q22.3)/ATM: ek sitogenetik/prognostik bilgi sağlar; tedavi seçimini tek başına belirlemez. |
|
|
Trizomi 12 / CEP12 |
Kromozom 12 sentromerik sinyal sayısı |
Trizomi 12: ek sitogenetik/prognostik bilgi sağlar; tedavi seçimini tek başına belirlemez. |
|
|
del(13q14.2) / D13S319 |
13q14.2 / D13S319 (DLEU1/MIR15A-MIR16-1) |
del(13q14.2)/D13S319: ek sitogenetik/prognostik bilgi sağlar; tedavi seçimini tek başına belirlemez. İzole bulgu diğer klinik/genetik verilerle birlikte yorumlanır. |
|
|
TP53 delesyonu |
17p13.1 / TP53 |
del(17p13.1)/TP53 delesyonunun saptanması; TP53 mutasyon analizi ile birlikte TP53 aberasyon durumunun değerlendirilmesi. |
|
|
IGH rearrangement / Break-apart FISH |
14q32 / IGH rearrangement |
IGH lokusunu içeren yeniden düzenlenmelerin taranması. Pozitif olgularda klinik/morfolojik bulgular doğrultusunda IGH::CCND1 [t(11;14)] ve/veya IGH::BCL3 [t(14;19)] için partner-spesifik refleks FISH uygulanabilir. |
|
|
3. TP53 moleküler analiz |
TP53 NGS |
TP53 tam kodlama bölgesi (ekzon 2–11) ve splice-site bölgeleri; SNV/indel; laboratuvarın valide analitik LoD’si üzerindeki raporlanabilir TP53 varyantları. |
del(17p) olmasa dahi TP53 mutasyonlarının saptanması. Sabit bir VAF raporlama eşiği kullanılmaz; laboratuvarın valide analitik LoD’si esas alınır. TP53 mutasyon durumu del(17p) FISH sonucu ile birlikte değerlendirilir ve tedavi seçimi açısından kritik öneme sahiptir. |
|
4. IGHV analizi |
IGHV yeniden düzenlenme / SHM analizi |
Produktif klonotipik IGHV-IGHD-IGHJ rearrangement; germline kimlik oranı; valide ise BcR IG stereotyped subset analizi (özellikle #2 ve #8) |
M-CLL / U-CLL sınıflaması ve prognostik/tedavi planlamasına katkı; valide stereotypy analizinde subset #2 ve #8 ayrıca değerlendirilebilir. |
|
5. Geniş moleküler profil |
Geniş KLL Moleküler Profil |
NOTCH1, SF3B1, BIRC3, ATM, XPO1, POT1, NFKBIE, RPS15, MYD88, EGR2, SAMHD1 vb.; valide kapsamda CNV |
Ek somatik/prognostik profilleme; TP53 dışındaki bulgular tedavi seçimini tek başına belirlemez. |
KLL Temel = del(17p)/TP53 FISH + TP53 NGS + IGHV SHM analizi.
KLL Geniş = KLL Temel + ileri sitogenetik değerlendirme (CpG/DSP30 ± IL-2 ile uyarılmış kromozom analizi) + ek genişletilmiş FISH hedefleri [del(6q)/MYB, del(11q22.3)/ATM, +12/CEP12, del(13q14.2)/D13S319, IGH break-apart] + geniş KLL moleküler profil.
Geniş kapsamındaki genişletilmiş sitogenetik ve moleküler incelemeler ileri biyolojik/prognostik karakterizasyon amacı taşır. EHA 2026'ya göre kompleks karyotip değerlendirmesi klinik çalışma dışında rutin tedavi öncesi değerlendirme olarak önerilmemekte; TP53 dışındaki geniş genomik profilleme ise rutin klinik uygulamada önerilmemektedir.
KLL Temel Panel ve Geniş Panel
KLL Temel Paneli, tanısı hematolojik ve akım sitometrik bulgularla konulmuş kronik lenfositik lösemi (KLL) olgularında tedavi öncesi genetik risk ve prediktif biyobelirteçlerin değerlendirilmesi amacıyla oluşturulmuş bir test yaklaşımıdır. Temel, KLL tanısını koyan akım sitometrik immünfenotiplemenin yerine geçmez.
KLL’de tedavi seçimi ve prognostik değerlendirme açısından özellikle TP53 aberasyonları [del(17p) ve/veya TP53 mutasyonu] ile IGHV somatik hipermutasyon durumu önemlidir. FISH, TP53 dizilemesi ve IGHV analizi birbirini tamamlayan yöntemlerdir.
Temel Panel kapsamında birbirini tamamlayan yöntemler
- Temel kapsamında del(17p13.1)/TP53 FISH ile 17p delesyonu değerlendirilir. del(17p) sonucu, TP53 mutasyon analizi ile birlikte TP53 aberasyon durumu açısından yorumlanır.
- TP53 NGS ile del(17p) bulunmasa dahi TP53 mutasyonları araştırılır; del(17p) ve TP53 mutasyonu birlikte “TP53 aberasyonu” açısından yorumlanır.
- IGHV analizi ile klonotipik produktif IGHV-IGHD-IGHJ yeniden düzenlenmesinin somatik hipermutasyon (SHM) durumu belirlenir; valide ise klinik önemi yerleşik BcR IG stereotyped subsetleri (özellikle #2 ve #8) ayrıca değerlendirilebilir.
- Geniş kapsamında Temel bileşenlerine ek olarak ileri sitogenetik değerlendirme [CpG/DSP30 ± IL-2 ile uyarılmış kromozom analizi], ek genişletilmiş FISH hedefleri [del(6q)/MYB, del(11q22.3)/ATM, +12/CEP12, del(13q14.2)/D13S319 ve IGH (14q32) break-apart] ve geniş KLL moleküler profil uygulanır. Bu ek bileşenler ileri biyolojik/prognostik karakterizasyon amacı taşır. EHA 2026'ya göre kompleks karyotip değerlendirmesi klinik çalışma dışında rutin tedavi öncesi değerlendirme olarak önerilmemekte; TP53 dışındaki geniş genomik profilleme ise rutin klinik uygulamada önerilmemektedir.
TP53 Aberasyonlarının Değerlendirilmesi
del(17p) değerlendirmesinde FISH temel yöntemdir; NGS tabanlı CNV analizi, özellikle düşük tümör fraksiyonunda del(17p) FISH’in yerini alacak şekilde kullanılmamalıdır. TP53 mutasyon analizi için NGS tercih edilen yöntemdir. ERIC 2024 yaklaşımına göre optimum kapsam TP53 kodlama bölgesinin ekzon 2-11’ini ve splice-site bölgelerini içerir; sabit bir VAF raporlama eşiği yerine laboratuvarın valide analitik LoD’si esas alınmalı ve bu sınırın üzerindeki klinik anlamlı TP53 varyantları raporlanmalıdır.
TP53 analizi örnek tümör hücre oranı dikkate alınarak yorumlanmalıdır. Periferik kan çoğu KLL olgusunda uygundur; düşük dolaşan CLL hücre oranında (özellikle düşük mutlak lenfosit sayısı/tümör fraksiyonu bulunan örneklerde) CD19+ hücre zenginleştirme, kemik iliği veya uygun doku örneği gerekebilir.
IGHV Mutasyon Durumu
IGHV SHM durumu klonotipik produktif rearrangement üzerinden değerlendirilir. Germline IGHV dizisine nükleotid kimliği ≥%98 ise U-CLL (unmutated), <%98 ise M-CLL (mutated) olarak sınıflandırılır. Germline kimliği %97.00–97.99 arasında olan olgular M-CLL sınıfında yer almakla birlikte ayrıca “borderline” olarak belirtilir ve prognostik yorumda dikkatle değerlendirilir. Non-produktif rearrangement’a M-CLL/U-CLL sınıflaması verilmez. ERIC önerilerine uygun ve valide stereotypy analizinde klinik önemi en yerleşik subsetler #2 ve #8’dir; subset #2 olumsuz prognostik özelliklerle, subset #8 ise artmış Richter transformasyonu riskiyle ilişkilidir. Hedefe yönelik tedaviler çağındaki prediktif önemleri ise henüz kesin değildir.
IGHV mutasyon durumu klonal olarak stabil kabul edildiğinden genellikle bir kez belirlenmesi yeterlidir; tedavi hatları arasında rutin tekrar gerektirmez.
KLL Geniş Panel Yaklaşımı
KLL Geniş Panel, Temel'in temel prediktif/risk belirteçlerine ek olarak ileri sitogenetik değerlendirme, genişletilmiş FISH profili ve geniş somatik DNA-NGS profillemesi ile daha kapsamlı biyolojik/prognostik karakterizasyon sağlar. NOTCH1, SF3B1, BIRC3, ATM, XPO1, POT1, NFKBIE, RPS15, MYD88, EGR2, SAMHD1 ve diğer KLL ilişkili genlerdeki değişiklikler hastalık biyolojisi ve prognoz açısından bilgi sağlayabilir; ancak klinik aksiyonabiliteleri TP53 ile eşdeğer değildir. EHA 2026'ya göre kompleks karyotip değerlendirmesi klinik çalışma dışında rutin tedavi öncesi değerlendirme olarak önerilmemekte; TP53 dışındaki geniş genomik profilleme ise rutin klinik uygulamada önerilmemektedir. Geniş bileşenleri ileri karakterizasyon amacıyla yorumlanmalıdır.
Geniş İleri Sitogenetik Değerlendirmesi: Uyarılmış Karyotip/Kompleks Karyotip
KLL hücrelerinin düşük spontan mitotik aktivitesi nedeniyle kromozom analizi uygun mitojenik uyarım ile yapılmalıdır. Geniş kapsamında CpG/DSP30 ± IL-2 ile uyarılmış kromozom analizi kullanılarak kompleks karyotip ve genişletilmiş FISH paneli dışında kalan ek sayısal/yapısal kromozomal anomaliler değerlendirilebilir. Kompleks karyotip genellikle ≥3 klonal sitogenetik anomali, yüksek kompleksite (high-CK) ise ≥5 anomali olarak tanımlanır. Bu inceleme Geniş içinde ileri sitogenetik karakterizasyon amacıyla yer almakla birlikte, EHA 2026'ya göre klinik çalışma dışında rutin tedavi öncesi değerlendirme olarak önerilmemektedir.
Test Zamanlaması ve Tekrar Analizleri
KLL’de genetik profil klonal evrim gösterebilir. Bu nedenle tedavi endikasyonu oluştuğunda ve her yeni tedavi hattı planlanırken TP53 aberasyon durumu [del(17p) + TP53 mutasyonu] yeniden değerlendirilmelidir. IGHV mutasyon durumu ise genellikle stabil olduğundan bir kez, tercihen ilk tedavi öncesinde belirlenir.
- İlk tedavi öncesi: del(17p)/TP53 FISH + TP53 mutasyon analizi + IGHV SHM durumu Temel'in temel genetik değerlendirmesidir. Genişletilmiş FISH hedefleri [del(6q)/MYB, del(11q22.3)/ATM, +12/CEP12, del(13q14.2)/D13S319 ve IGH break-apart] Geniş kapsamında ek sitogenetik/prognostik veya ayırıcı tanısal bilgi amacıyla değerlendirilebilir.
- Geniş seçildiğinde: Temel bileşenlerine ek olarak CpG/DSP30 ± IL-2 ile uyarılmış kromozom analizi, genişletilmiş KLL FISH profili ve geniş KLL moleküler profil uygulanır. Bu ek incelemeler ileri biyolojik/prognostik karakterizasyon amacı taşır ve EHA 2026 çekirdek tedavi öncesi biyobelirteç setinin parçası değildir.
- Sonraki tedavi hatları öncesi: del(17p)/FISH ve TP53 mutasyon durumu yeniden değerlendirilmelidir; geniş moleküler testler klinik bağlama göre tekrarlanabilir.
- IGHV: daha önce güvenilir şekilde belirlenmişse rutin olarak tekrar edilmez.
Takip ve Ek/İleri Değerlendirmeler
Temel / Geniş sonuçlarına, kullanılan tedaviye, relaps/progresyon paternine ve klinik gereksinime göre bazı takip testleri, tedavi sürecinde ek incelemeler veya daha ileri değerlendirmeler ikinci aşamada planlanabilir.
Hedefe Yönelik Direnç Mutasyonları
BTK inhibitörü veya BCL2 inhibitörü tedavisi sonrasında progresyon/direnç gelişen seçilmiş olgularda BTK, PLCG2 ve BCL2 gibi tedavi direnciyle ilişkili hedefler klinik gereksinime göre analiz edilebilir. Bu testler yeni tanı KLL Temel’in rutin başlangıç içeriğinde yer almaz. Direnç mutasyonunun saptanması biyolojik bilgi sağlayabilir; ancak tek başına tedavi değişikliği gerekçesi olarak kullanılmamalı ve klinik progresyon, kullanılan ajan ve tedavi öyküsü ile birlikte yorumlanmalıdır.
Richter Transformasyonu Şüphesi
Hızlı klinik progresyon, belirgin LDH artışı, yeni/büyüyen nodal kitle veya diğer klinik bulgularla Richter transformasyonu şüphesi oluştuğunda tercih edilen yaklaşım uygun lezyondan doku biyopsisi ve patolojik doğrulamadır. Genetik/moleküler analizler doku bulguları ve klinik gereksinime göre genişletilebilir; bu durum KLL Temel’in rutin başlangıç kapsamından ayrıdır.
MRD Değerlendirmesi
Ölçülebilir rezidüel hastalık (MRD) KLL’de prognostik ve araştırma açısından değerlidir; ancak başlangıç Temel/Geniş panelinin rutin bileşeni değildir. MRD, kullanılan zaman-sınırlı tedavi protokolü, klinik çalışma veya özel klinik gereksinime göre valide çok parametreli akım sitometri ve/veya moleküler yöntemlerle ayrı takip testi olarak planlanabilir.
Bütüncül Değerlendirme
KLL Temel; del(17p)/TP53 FISH, TP53 mutasyon analizi ve IGHV SHM durumu ile EHA 2026'ya uyumlu temel tedavi öncesi genetik risk/prediktif profili oluşturmayı amaçlar. KLL Geniş ise buna ileri sitogenetik değerlendirme [CpG/DSP30 ± IL-2 ile uyarılmış kromozom analizi], genişletilmiş KLL FISH profili ve geniş somatik moleküler profillemeyi ekler. Geniş'ın ek bileşenleri ileri biyolojik/prognostik karakterizasyon amacıyla yorumlanmalı; rutin tedavi seçimi açısından TP53 aberasyonları ve IGHV ile aynı ağırlıkta değerlendirilmemelidir. Tedavi sürecindeki direnç analizleri ve MRD değerlendirmeleri ayrı klinik endikasyonlarla planlanır.
|
RUTİN / TAKİP / EK-İLERİ ANALİZ KAPSAMI |
KLL Temel ve Geniş bileşenleri ile seçilmiş klinik durumlarda uygulanacak tedavi sürecindeki ek incelemeler, ek/ileri değerlendirmeler ve takip testleri aşağıda özetlenmiştir. KLL tanısının akım sitometrik immünfenotipleme ile konulduğu varsayılır. |
|||
|
Durum |
Test / Yöntem |
Hedef / Kapsam |
Zaman |
Amaç / Açıklama |
|
Temel |
del(17p)/TP53 FISH |
17p13.1 / TP53 delesyonu |
İlk tedavi öncesi ve her yeni tedavi hattı öncesi |
del(17p)/TP53 delesyonunun saptanması; TP53 mutasyon analizi ile birlikte TP53 aberasyon durumunun belirlenmesi. |
|
Temel |
TP53 NGS |
TP53 tam kodlama bölgesi (ekzon 2–11) ve splice-site bölgeleri; SNV/indel; laboratuvarın valide analitik LoD’si üzerindeki raporlanabilir TP53 varyantları. |
Her yeni tedavi hattı öncesi |
TP53 mutasyonlarının saptanması; del(17p) ile birlikte TP53 aberasyon durumunun belirlenmesi. |
|
Temel |
IGHV SHM analizi |
Produktif IGHV-IGHD-IGHJ; germline kimlik oranı; valide ise stereotyped subset #2/#8 |
Genellikle bir kez |
M-CLL/U-CLL sınıflaması ve prognostik/tedavi planlamasına katkı; valide ise klinik önemi yerleşik BcR IG subsetleri #2 ve #8 ayrıca raporlanabilir. |
|
Geniş |
Uyarılmış kromozom analizi (CpG/DSP30 ± IL-2) |
Kompleks karyotip ve ek sayısal/yapısal kromozomal değişiklikler |
İleri karakterizasyon amacıyla / seçilmiş olgularda |
Kompleks karyotip ve genişletilmiş FISH paneli dışında kalan ek kromozomal değişikliklerin değerlendirilmesi. Geniş kapsamında ileri sitogenetik bileşen olarak yer alır; EHA 2026'ya göre klinik çalışma dışında rutin tedavi öncesi değerlendirme olarak önerilmemektedir. |
|
Geniş |
Genişletilmiş KLL FISH profili |
del(6q)/MYB; del(11q22.3)/ATM; +12/CEP12; del(13q14.2)/D13S319; del(17p13.1)/TP53; IGH (14q32) break-apart |
İleri karakterizasyon amacıyla / klinik gereksinime göre |
Ek sitogenetik/prognostik ve ayırıcı tanısal karakterizasyon. IGH break-apart pozitifliğinde klinik/morfolojik bağlama göre IGH::CCND1 ve/veya IGH::BCL3 için partner-spesifik refleks FISH uygulanabilir. |
|
Geniş |
Geniş KLL Moleküler Profil |
KLL ilişkili somatik genler; valide kapsamda CNV |
Seçilmiş olgularda / klinik gereksinime göre |
Ek moleküler/prognostik karakterizasyon; TP53 dışındaki geniş gen profilinin rutin tedavi seçimini tek başına belirlemediği dikkate alınır. |
|
Tedavi sürecinde ek inceleme |
BTK / PLCG2 / BCL2 direnç analizi |
Tedaviye özgü direnç varyantları |
İlgili hedefli tedavi sonrası progresyonda |
Direnç mekanizmasının araştırılması; yeni tanıda rutin değildir ve mutasyon sonucu tek başına tedavi değişikliği gerekçesi değildir. |
|
Ek / ileri inceleme |
Doku biyopsisi + geniş moleküler profil |
Richter transformasyonu şüphesi |
Klinik şüphede |
Transformasyonun patolojik doğrulanması ve gerektiğinde ileri genetik karakterizasyon. |
|
Takip / MRD |
MRD analizi |
Valide flow ve/veya moleküler yöntem |
Protokole göre |
Rutin başlangıç panelinden ayrı takip testi; klinik protokol/çalışmaya göre kullanılır. |
Kılavuz uyumu notu: Temel, EHA 2026 yaklaşımına uygun olarak del(17p)/TP53 FISH, TP53 mutasyon analizi ve IGHV SHM durumunu temel tedavi öncesi genetik değerlendirme olarak içerir. TP53 aberasyonları [del(17p) + TP53 mutasyonu] her tedavi hattı öncesinde; IGHV SHM durumu ise genellikle bir kez, tercihen ilk tedavi öncesinde değerlendirilir. Geniş'taki genişletilmiş FISH, uyarılmış kromozom analizi/kompleks karyotip ve TP53 dışındaki geniş moleküler profil ileri biyolojik/prognostik karakterizasyon amacı taşır ve rutin tedavi seçimi için çekirdek biyobelirteçlerle aynı ağırlıkta yorumlanmamalıdır.
Önemli: del(17p) için FISH, TP53 mutasyonu için dizileme gereklidir; bu iki analiz birbirinin yerine geçmez. TP53 NGS raporlamasında laboratuvarın valide LoD'si esas alınmalıdır. Geniş kapsamında yer alan genişletilmiş FISH, kompleks karyotip ve TP53 dışındaki geniş somatik panel bulguları klinik bağlamda ek biyolojik/prognostik bilgi olarak değerlendirilmelidir.
|
TEKNİK ANALİZ KAPSAMI VE GEN LİSTESİ |
Geniş KLL Moleküler Profil uygulanması halinde bu bölümde yer alan 443 gen, testin teknik Full CDS analiz kapsamını gösterir. Bu liste, KLL'de tüm genlerin rutin klinik olarak önerildiği, eşdeğer ağırlıkta yorumlandığı veya tedavi kararını belirlediği anlamına gelmez. Klinik yorum, valide analiz kapsamı ve güncel kanıt düzeyi doğrultusunda yapılır; EHA 2026'ya göre TP53 dışındaki geniş genomik profilleme rutin klinik uygulamada önerilmemektedir. Liste dışındaki genler açısından negatif sonuç veya analitik duyarlılık garantisi verilmez. |
||||||
|
GENİŞ KLL MOLEKÜLER PROFİL - TEKNİK FULL CDS GEN LİSTESİ |
|||||||
|
Aşağıdaki genler laboratuvarın valide Full-CDS teknik DNA-NGS kapsamındadır. KLL’ye özgü klinik yorumlama; TP53 başta olmak üzere KLL ile ilişkili yerleşik ve klinik açıdan anlamlı genler üzerinden yapılır. Liste içerisindeki tüm genlerin KLL’de eşdeğer klinik önemi olduğu anlamına gelmez. |
|||||||
|
GEN 1 |
GEN 2 |
GEN 3 |
GEN 4 |
GEN 5 |
GEN 6 |
GEN 7 |
|
|
ABL1 |
ABL2 |
ACTB |
AKT1 |
AKT2 |
AKT3 |
ALK |
|
|
AMER1 |
ANKRD26 |
AP3B1 |
APC |
AR |
ARAF |
ARHGAP26 |
|
|
ARID1A |
ARID1B |
ARID2 |
ARID5B |
ASXL1 |
ASXL2 |
ASXL3 |
|
|
ATG5 |
ATM |
ATR |
ATRX |
ATXN1 |
AURKA |
AURKB |
|
|
AXIN1 |
AXL |
B2M |
BAALC |
BAP1 |
BARD1 |
BCL10 |
|
|
BCL11A |
BCL11B |
BCL2 |
BCL6 |
BCL7A |
BCOR |
BCORL1 |
|
|
BIRC3 |
BLM |
BLNK |
BRAF |
BRCA1 |
BRCA2 |
BRD4 |
|
|
BTG1 |
BTG2 |
BTK |
BTLA |
CALR |
CARD11 |
CBFB |
|
|
CBL |
CBLB |
CCND1 |
CCND2 |
CCND3 |
CCNE1 |
CCR4 |
|
|
CCR7 |
CCT6B |
CD22 |
CD27 |
CD274 |
CD28 |
CD58 |
|
|
CD70 |
CD79A |
CD79B |
CD83 |
CDC42 |
CDC73 |
CDH1 |
|
|
CDK12 |
CDK4 |
CDK6 |
CDK8 |
CDKN1A |
CDKN1B |
CDKN1C |
|
|
CDKN2A |
CDKN2B |
CDKN2C |
CEBPA |
CEP57 |
CHD2 |
CHD8 |
|
|
CHEK1 |
CHEK2 |
CIITA |
CKS1B |
CNOT3 |
CREBBP |
CRLF2 |
|
|
CSF1R |
CSF3R |
CTCF |
CTLA4 |
CTNNB1 |
CUX1 |
CXCR4 |
|
|
CYLD |
DAXX |
DDR2 |
DDX3X |
DDX41 |
DHX15 |
DNM2 |
|
|
DNMT3A |
DOT1L |
DTX1 |
DUSP2 |
DUSP22 |
EBF1 |
ECT2L |
|
|
EED |
EGFR |
EGR2 |
EP300 |
EPCAM |
EPHA2 |
EPHA3 |
|
|
EPHA5 |
EPHA7 |
EPOR |
ERBB2 |
ERBB3 |
ERBB4 |
ERCC4 |
|
|
ERG |
ESR1 |
ETNK1 |
ETS1 |
ETV1 |
ETV4 |
ETV6 |
|
|
EZH2 |
TENT5C |
FANCA |
FANCC |
FANCD2 |
FANCE |
FANCF |
|
|
FANCG |
FANCI |
BRIP1 |
FANCL |
FANCM |
FAS |
FAT1 |
|
|
FAT4 |
FBXO11 |
FBXW7 |
FGFR1 |
FGFR2 |
FGFR3 |
FGFR4 |
|
|
FH |
FLCN |
FLT1 |
FLT3 |
FLT4 |
FOXO1 |
FOXO3 |
|
|
FOXP1 |
FYN |
GADD45B |
GATA1 |
GATA2 |
GATA3 |
GNA11 |
|
|
GNA13 |
GNAQ |
GNAS |
GNB1 |
GRIN2A |
HACE1 |
HBA1 |
|
|
HBA2 |
HBB |
HDAC1 |
HDAC4 |
HDAC7 |
HGF |
HIST1H1A |
|
|
HIST1H1C |
HIST1H1D |
H1-4 |
HNF1A |
HRAS |
ID3 |
IDH1 |
|
|
IDH2 |
IFNAR2 |
IGF1R |
IGH |
IGK |
IGL |
IGLL5 |
|
|
IKBKE |
IKZF1 |
IKZF2 |
IKZF3 |
IL3 |
IL7R |
INPP4B |
|
|
INPP5D |
IRF1 |
IRF4 |
IRF8 |
ITK |
ITPKB |
JAK1 |
|
|
JAK2 |
JAK3 |
JARID2 |
JUN |
KAT6A |
KDM2B |
KDM5A |
|
|
KDM5C |
KDM6A |
KDR |
KIT |
KLF2 |
KLHL5 |
KLHL6 |
|
|
KMT2A |
KMT2B |
KMT2C |
KMT2D |
KRAS |
LEF1 |
LMO2 |
|
|
LRP1B |
LTB |
LYN |
LYST |
MAF |
MAFB |
MALT1 |
|
|
MAP2K1 |
MAP2K2 |
MAP2K4 |
MAP3K1 |
MAP3K14 |
MAPK1 |
MCL1 |
|
|
MDM2 |
MDM4 |
MED12 |
MEF2B |
MEF2D |
MEN1 |
MET |
|
|
MFHAS1 |
MGA |
MITF |
MLH1 |
MPL |
MSH2 |
MSH3 |
|
|
MSH6 |
MTOR |
MUTYH |
MYB |
MYC |
MYCL |
MYCN |
|
|
MYD88 |
NBN |
NCKAP1L |
NCSTN |
NF1 |
NF2 |
NFE2L2 |
|
|
NFKB1 |
NFKB2 |
NFKBIA |
NFKBIE |
NKX2-1 |
NLRC4 |
NOTCH1 |
|
|
NOTCH2 |
NPM1 |
NRAS |
NSD1 |
NT5C2 |
NTRK1 |
NTRK3 |
|
|
NUP98 |
P2RY8 |
PAG1 |
PAK3 |
PALB2 |
PAX5 |
PBRM1 |
|
|
PC |
PDCD1 |
PDCD1LG2 |
PDGFRA |
PDGFRB |
PDK1 |
PHF6 |
|
|
PIK3CA |
PIK3CD |
PIK3R1 |
PIK3R2 |
PIM1 |
PLCG1 |
PLCG2 |
|
|
PML |
PMS2 |
POLE |
POT1 |
POU2AF1 |
PPM1D |
PPP2R1A |
|
|
PRDM1 |
PRF1 |
PRKCB |
PRPF8 |
PTCH1 |
PTEN |
PTPN1 |
|
|
PTPN11 |
PTPN2 |
PTPN6 |
PTPRD |
PTPRK |
PTPRO |
RAB27A |
|
|
RAD21 |
RAD50 |
RAD51 |
RAF1 |
RARA |
RASGEF1A |
RB1 |
|
|
RECQL4 |
REL |
RELN |
RET |
RHOA |
RICTOR |
RNF43 |
|
|
ROS1 |
RPL10 |
RPL22 |
RPL5 |
RPS15 |
RPTOR |
RUNX1 |
|
|
SAMD9 |
SAMD9L |
SAMHD1 |
SBDS |
SDHA |
SDHB |
SDHC |
|
|
SDHD |
SETBP1 |
SETD2 |
SF3B1 |
SGK1 |
SH2B3 |
SH2D1A |
|
|
SLC19A1 |
SLC7A7 |
SMAD2 |
SMAD4 |
SMARCA2 |
SMARCA4 |
SMARCB1 |
|
|
SMC1A |
SMC3 |
SMO |
SOCS1 |
SOX11 |
SOX2 |
SPEN |
|
|
SPOP |
SRC |
SRP72 |
SRSF2 |
STAG2 |
STAT3 |
STAT4 |
|
|
STAT5A |
STAT5B |
STAT6 |
STK11 |
STX11 |
STXBP2 |
SUFU |
|
|
SUZ12 |
SYK |
TBL1XR1 |
TCF3 |
TCL1A |
TERC |
TERT |
|
|
TET1 |
TET2 |
TET3 |
TGFBR2 |
TNFAIP3 |
TNFRSF11A |
TNFRSF14 |
|
|
TNFRSF17 |
TNFRSF1B |
TOP1 |
TOP2A |
TP53 |
TP63 |
TP73 |
|
|
TRAF2 |
TRAF3 |
TRAF5 |
TSC1 |
TSC2 |
TSHR |
TYK2 |
|
|
U2AF1 |
UNC13D |
USP7 |
VAV1 |
VHL |
NSD2 |
WT1 |
|
|
XIAP |
XPC |
XPO1 |
ZAP70 |
ZBTB7A |
ZEB2 |
ZFP36L2 |
|
|
ZMYM3 |
ZRSR2 |
|
|
|
|
|
|
